По температуре вод, изменению ее с глубиной Японское море не похоже ни на одно из других морей, омывающих берега Советского Союза.
Судя по поверхностным температурам в летнее время года, это — теплое море. На глубинах же вода холодная, только на одну-две десятых градуса выше нуля. Прежде всего бросается в глаза поразительная однородность температуры глубинных слоев. Начиная с 400—500 м в восточной части моря и с 200 м в западной, температура воды составляет 0,1—0,2°.
Характерно отсутствие отрицательных температур воды у дна на больших глубинах моря¹. Между тем, казалось бы, что водные массы, охладившись зимой до —1,7° в северных районах моря, должны сползать на глубины центральной котловины моря. Конечно, при этом они смешиваются с окружающими водами и температура их несколько повышается, но поскольку холодные воды на глубину поступают каждую зиму в течение долгого времени, то должно было бы наблюдаться постепенное охлаждение глубинных вод. Однако этого не происходит: никакой тенденции к похолоданию не замечено. Очевидно, глубинные воды достигают своего термического равновесия, то есть охлаждение, вызванное поступлением вод с отрицательными температурами из северной части моря, компенсируется в известной степени притоком внутреннего тепла земли, а также поступлением тепла из поверхностных слоев южной теплой части моря.