Первый микроскоп, изобретённый человеком, был представлен в 1538 году Дж. Фракасторо, итальянским учёным и естествоиспытателем. Он состоял их двух скомбинированных между собой линз и давал относительно небольшое увеличение, хотя и в значительной мере выигрывал по сравнению с безсомненным лидером того времени — лупами, но из-за слишком неудобной и причудливой конструкции данное изобретение не пришлось в научной среде.Первый полноценный микроскоп, который был относительно похож на современные, был предложен в 1590 году офтальмологом из Голландии по имени Иоан Липерсгей. Он разрабатывал его в содружестве со своим товарищем, занимавшимся созданием очков — Захраием Янсеном.Первый составной микроскоп был предложен Галилео Галилеем в 1624 году, но изначально он назывался "оккиолино", что дословно переводилось с итальянского, как "маленький глаз". Этот микроскоп уже получил признание в широком научном сообществе и через один год друг Галилео Галилея, Джованни Фабер предложил для данного изобретения название микроскоп.После этого начинается бурное развитие микробиологии, учёные начинают бурное исследование морфологии одноклеточных организмов, описывается огромное количество новых видов бактерий и других простейших, устанавливаются взаимосвязи между строением различных бактерий и их физиологией. Разрабатывается таксономическая система классификации одноклеточных организмов.С течением времени учёные работали над усложнением строения данного приспособления и начали более подробно исследовать строение разнообразных клеток многоклеточных организмов, устанавливать взаимосвязи между выполняемыми ими функциями и их морфологией, а также работать над развитием электронного микроскопа. В конечном итоге в 1931 году был изобретён первый электронный микроскоп, благодаря которому получила бурное развитие генетика, вирусология и наука о строении вещества. Необходимо отметить, что развитие микроскопов продолжается и по сегодняшний день. Многие учёные всерьез заняты работой над улучшением уже существующих моделей электронных и оптических микроскопов, а также разработками принципиально новых приспособлений, направленных на то, чтобы увеличивать микроскопические объекты.